大聖堂の中の礼拝堂は騎士団の言語によりグループ分けされています。礼拝堂は祭壇の側面にあり、個々の言語の騎士団長の霊廟でもあり、それぞれ、競うように素晴らしい礼拝堂です。マルタ島のホームページでは主として聖ヨハネ大聖堂内部に焦点をあてる予定です。教会や城に飾られているものはその時代の最高傑作で美術館で見る時とは感動が違うように感じられます。