マルタ島のマルタ騎士団の守護聖人ヨハネに捧げられた教会です。1573年騎士団長ジャン・デ・ラ・カッシュールは聖ヨハネ騎士団の為に教会建設を許可しました。1578年マルタ出身のジローラモ・カッサールにより教会は完成されました。大聖堂の外部とは違い内部は大変見事です。
聖ヨハネ 大聖堂美術館にはカラヴァッジョ作の絵画「聖ヨハネの斬首」他があります。